Phoenix
Projetado para transportar até seis mísseis ar-ar de longo alcance AIM-54 Phoenix, raramente o Tomcat voava com essa configuração. O Phoenix era uma arma grande e pesada. Em 1986, cada AIM-54 custava US$ 500 mil, o que limitava o seu uso e treinamento real. Ao Phoenix são atribuídas 62 vitórias ar-ar. Curiosamente, nenhuma dessas vitórias ocorreu sob as cores da Marinha dos Estados Unidos; todas foram alcançadas pela Força Aérea iraniana durante a Guerra Irã-Iraque (1980–1988). O Tomcat só conseguia pousar em segurança no porta-aviões com o mínimo de combustível se estivesse carregando a carga total de Phoenix.